הבדיקות המולקולריות המבוצעות בבית החולים מחולקות למס' סוגים:

• בדיקה מולקולרית איכותית – איתור פתוגן יחיד ללא התייחסות כמותית.
• בדיקה מולקולרית לקביעת עומס נגיפי – ספציפית לפתוגן אחד (דוגמה – CMV viral load)
• פאנל מולקולרי  – בדיקה איכותית המבוססות על פאנל קבוע מראש המכוון כנגד מס' מחוללים ספציפיים ובמרבית המקרים אף מותאם לסוג הדגימה (CSF, הפרשות נשימתיות, צואה וכיו"ב) – STD, Biofire meningitis, וכו'.
• ריצוף גנטי של חומצות גרעין – בדיקה איכותית המשמשת לאיתור מחולל מאתרים סטריליים ומבוססת על הפקת חומצות הגרעין, ביצוע ריצוף לאתר שמור בגנום, קביעת רמת הומולוגיה ע"י השוואתו לבסיס נתונים קיים – (Pan-bacterial או Pan fungal PCR)

מתי נשתמש בבדיקות מולקולריות ?
1. במצבים בהם אנו מעוניינים לאתר מחולל ויראלי ואין מענה סרולוגי להשלמת התמונה.
2. כאשר התמונה הקלינית מתאימה למחלה על רקע זיהומי אך התרביות הראשוניות שליליות.
3. כאשר אנו חושדים במחולל לא טיפוסי שקשה לגדלו בתנאי תרבית  או שכלל אינו גדל (פתוגן אינטראצלולרי אובליגטורי למשל).
4. במקרים בהם החולה קיבל טיפול אנטימיקרוביאלי טרם נטילת הדגימה והתרבית עקרה.

כלל הבדיקות הללו דורשות אישור רופאי היחידה למחלות זיהומיות ומעבר לכך, מומלץ לשוחח עמנו טרם נטילת הבדיקה.