יש לדחות את ביצוע הניתוח עד לאחר שליטה בזיהום ועדיף לאחר סיום הטיפול בזיהום.

בניתוח סמי-אלקטיבי – לשיקול פרטני. ככלל, ניתן לבצע את הניתוח כשהזיהום נשלט.

בקטיריאוריה אסימפטומטית אינה דורשת דחיית ניתוח למעט ניתוחים אורולוגים